Musim berubah menjadi musim gugur. Perjuangan sang protagonis dan kelompoknya S.E.E.S. dengan monster aneh yang disebut ‘Shadows’ semakin mendekati akhir. Makoto dan sekutunya terlibat dalam pertempuran hidup atau mati dengan Shadows untuk mengakhiri Jam Gelap. Melalui pertempuran, beberapa harus menghadapi kematian teman dan keluarga, beberapa orang harus memperhatikan hal-hal berharga yang harus dilindungi, dan beberapa harus menemukan makna dalam pertempuran yang telah terjadi. Di depan Makoto, murid transfer misterius Ryouji Mochizuki muncul. Ketika kelompok menyapa suatu pagi baru, roda gigi nasib mulai berubah. Pertarungan berputar di sekitar masing-masing ikatan pahlawan dimulai …